За пределы файла сохраненки на том же разделе (методом создания ссылок) вынесены в отдельную папку v (для уменьшения размера сохраненки и возможности работы с этими данными из других Пуппи, лучше создать нужные заранее, даже пустые) папки. Можете и ничего не выносить, но тогда ваша сохраненка может стать очень даже огромной по размеру.

Делаем папку на разделе, где устанавливаются разные Пуппи, с именем, например, xlpr528_vvvvv и извлекаем в нее с помощью Менеджера архивов все содержимое (если будет новый загрузчик), или только:

Приступаем к ремастерингу, наконец-то. Примонтируем ISO образ исходной Иванны или вставляем в привод записанный CD.

И вот, приступаю к выжиганию каленым железом SeaMonkey. В принципе, при правильной сборке в /root/.packages/builtin_files должен найтись одноименный файл, в котором расписаны все файлы программы с путями к ним. Но, с этой программой не повезло... А установленные уже после очередного ремастеринга оказываются расписаны в папке на уровень выше.
Если не хочется задумываться, где лежат файлы, - Меню - Файловая система - Pfind - Расширенный - Поиск в - выбрать всю ФС, Во вложенных каталогах, Поиск по: SeaMonkey - В именах файлов
У меня нашлось 12 ссылок. Методично удаляю напрочь все эти папки/файлы. Кстати, кто не знает, находясь в окне Thunar, можно начать набирать имя файла, и вы окажетесь сразу на нужном.
Так-с... Что бы еще выжечь? На мелочи можно не обращать внимания, а вот большие по объему программы не мешало бы удалить. Мне лично не нужны HomeBank, XChat, Psip и другие. Но, пожалуй, ограничусь удалением HomeBank (кому нужно, найдут и установят пакет), для примера. Читаем /root/.packages/builtin_files/homebank и удаляем согласно списка. Иконки в /usr/share/icons оставлю, вдруг, пригодятся для других программ, размер в пару десятков Кбайт несущественен.
Остальные мелкие программы, мне ненужные, прячу из меню в applications_No_Visible, можете вернуть.
Естественно, хочется, чтобы после первого запуска ОС у вас был браузер. Поэтому нужно его скачать заранее, в виде SFS (браузеры часто обновляются, и легко будет заменять весь SFS), и положить в папку SFS рядом с системной папкой. Рекомендую Оперу.
Те из них, которые пожелаете иметь автоподключамыми, в будущем переместите в саму сист.папку, рядом с luci_528.sfs.
Немного перемещений ярлыков в панелях и их настроек, особо описывать не буду. Если в другой системе уже были сделаны ярлыки для панелей, и они сохранены из папки /root/.config/xfce4/panel, то легко добавить их перетаскиванием на окно свойств элемента левой панели. Или добавляйте из /usr/share/applications. Что и делаю, для некоторых программ. Восстановление менеджера буфера обмена Glipper тоже добавил.
Очистить корзину, если там что-то оказалось, и можно приступать к ремастерингу! На всякий, сразу после перезагрузки.

Устанавливаю в виде PET только небольшие программы:
+ fbxkb-0.4-i486.pet - простой переключатель раскладки, запускаю в меню - Рабочий стол - Swither keyboard, проверяю переключение с помощью CapsLock, закрываю прежний переключатель (а из автозагруки мы уже его убрали)
+ Disk_desktop.pet - иконки разделов и подключаемых устройств на раб.столе (вместо папки Computer). Кому очень нравятся лишние движения мышкой для входа в ту папку, смогут вернуть ее обратно, будет нужда. После рестарта X иконки на раб.столе появятся.
+ Conky-1.8.0-Lucid.pet - сист.информация на раб.столе. Кладу в /root/Startup ссылку на /usr/share/applications/conky.desktop, перетаскивая туда файл при нажатых Ctrl+Shift.
+ gthumb_2.10.11.pet - просмотр и редактирование фотографий
Скрипт /usr/sbin/load_sfs изменен, чтобы после подключения SFS двойным щелчком задавался вопрос, а не запустить ли саму программу? Исходный переименован в 000load_sfs, лежит в той же папке. Вообще, полезно сохранять исходные файлы, а с ноликами в начале имени они сразу видны.
Кажется, всё! Сделаем перезагрузку X - Ctrl+Alt+Backspace, и приступим к удалению "лишних" программ.
Да, еще расставим иконки на раб.столе, как нам хочется. В принципе, можно бы также отредактировать файлы в /usr/share/applications, но... займусь я этим уже в своей личной системе, тем более, что мне можно будет просто заменить эту папку на уже имеющуюся, настроенную. Так что на нелогичное размещение в меню, отсутствие иконок - жалобы не принимаются...

После перезагрузки продолжаю. Задача - удалить из системы, по моему мнению, лишнее. Кое-что оставлю, вдруг когда-нибудь надумаю выложить вариант сразу после ремастеринга. Например, кому-то нравится Wbar, рисунок на раб.столе и др.
Но другое решительно буду удалять!

Есть желание что-то удалить из новой ОС? Тогда при первой загрузке ОС ничего лишнего не запускаем, не меняем, не настраиваем, интернет в том числе, чтобы меньше мусора добавлялось. И сразу делаем ремастеринг. Новичкам не рекомендуется с этого начинать, конечно. Будет желание непрерывно что-то менять и улучшать для себя, займетесь этим позже, в N-й раз переустанавливая систему. Но я описываю последовательность своих действий с конкретным дистрибутивом. Опуская несущественные настройки.

Исходный ISO Иванны xLupuRus528_IvannaSE.iso
Конечный результат - установлено на трех разных машинах, установка frugal:
- стационарный комп: 2x AMD Athlon(tm) 64 X2 Dual Core 5000+, 2074MB, nVidia G84 [GeForce 8600 GTS], nVidia MCP65 High Definition Audio, Ethernet: RTL8111/8168B PCI Express Gigabit
- ноутбук DNS: AMD Athlon(tm) TF-20 1595,00 MHz, 1813MB, Radeon X1200, Network: Realtek Device 8172 и Ethernet: JMC260 PCI
- ноутбук COMPAQ Evo N410c: Pentium III Mobile CPU 1000MHz, 515MB. Radeon Mobility M6 LY, Intel 82801CA/CAM AC'97 Audio, Ethernet: Intel 82557/8/9/0/1 Ethernet Pro 100
И во всех них проблем с железом не было.
Кроме того, устанавливал на флэшках 2 ГБ и 16 ГБ, с ФС ext2 и fat32, делал и два разных раздела на большой флэшке. С флэшек все мои (и не только) компы успешно запускались с Пуппи, с минимальными подстройками при первом запуске.
Как именно устанавливал - это отдельная тема, надеюсь написать подробно позже. Смотрите об этом:
Установка и загрузка
Установка PuppyRus Linux

Уважаемые пользователи PuppyRus, всех многочисленных вариантов! Помню, как мне трудно было поначалу разобраться, что, где и как... Какой именно дистрибутив выбрать, какие программы будут работать, какие нет, где их взять, как удобно настроить систему, как решать проблемы, кажущиеся неразрешимыми. Ну не сделан еще такой дистрибутив в Пуппи, где совсем ничего не захочется переделывать... Да и не будет, видимо, сделан. Ни у кого нет времени и желания шлифовать систему до последней буковки, сборщики дистрибутивов, естественно, доводят до какой-то стадии свое творение, а потом оставляют его нам, обычным пользователям. А сами уходят творить нечто новое. Которое далеко не всегда лучше старого, но их зовет именно новизна, это затягивает.
В Линукс я пришел чуть менее двух лет назад, через полгода уже смог отказаться от Винды, и после опробования кучи Линуксов, больших и маленьких, решил остановиться на весьма надежном и симпатичном варианте - xLupuRus528_IvannaSE.iso - сборкой от andy-voit (Андрей Войтов). Остановиться, чтобы пользоваться ей на всю катушку, у меня в ноутбуке это система для повседневного пользования, обеспечивающая все мои требования к ОС. Только в серии 510...528 нашелся драйвер для моей карты wi-fi, это первоначально и определило мой выбор. Долго обкатывал 510-ю, немного успел 520-ю, и вот, пришла Иванна, и я ей отдался с потрохами    
Успел уже много написать на этом форуме (да и на техническом тоже), выкладывал различные варианты настроенной Иванны. И понял, что мне нужен именно свой блог на форуме, где я могу последовательно описывать свои деяния, делиться опытом. Пишу я очень подробно, можно сказать, пошаговые инструкции. Чтобы начинающие пользователи Пуппи могли самостоятельно, без лишних отвлечений на поиск информации, делать свою систему удобной для себя. Естественно, мои действия - лишь пример для них, вовсе не следует делать все в точности, как я, но по аналогии будет легко делать то, на что они, возможно, и не отважились бы. Надеюсь, моя писанина будет им полезна...
Важно! Предупреждаю, что по мере моего продвижения в мир Пуппи версии будут меняться, и дистрибутивов, и программ, поэтому ссылки могут оказаться и нерабочими, за всем уследить весьма непросто. Следите за процессом развития :)
P.S. В конце-концов, решил оставить лишь одну версию - http://uco.puppyrus.org/blogs/delaem-sistemu-luchshe-xlupurus528-dlja-nachinayushih/obnovlenie-iso.html - в ней нет вынесенки (займетесь сами), удобна для установки как на винт, так и на флэшку, огромное количество пересобранных мной и выложенных тоже SFS подключаются и работают без проблем.
Список ссылок на SFS с ПО - http://uco.puppyrus.org/blogs/delaem-sistemu-luchshe-xlupurus528-dlja-nachinayushih/novyi-spisok-sfs-i-prochego.html
Список ссылок на SFS с ПО под wine - http://uco.puppyrus.org/blogs/delaem-sistemu-luchshe-xlupurus528-dlja-nachinayushih/sylki-na-sfs-pod-wine.html
SFS с играми под wine - http://uco.puppyrus.org/blogs/delaem-sistemu-luchshe-xlupurus528-dlja-nachinayushih/shtampuyu-sfs-s-igrami-pod-wine.html

У меня это с LINUX впервые,но удалось установить в puppyrus простенькую игру типа зумы и подключится к интернету через USB-модем благодаря тому,что в puppyrus всё очень доходчиво разъясняется.